Remplacement massif d'agents pathogènes multirésistants chez l'homme, les animaux domestiques et les animaux sauvages

Réévaluer la prévalence et la transmission d'agents pathogènes multirésistants
L'échange de pathogènes entre l'homme, les animaux domestiques et les animaux sauvages a une influence déterminante sur la propagation de la résistance aux antibiotiques, selon les résultats d'une étude internationale impliquant des chercheurs de la Freie Universität Berlin et de l'Institut Robert Koch (RKI). Les chercheurs ont publié les résultats de leur étude dans la revue "PLoS Genetics".

Les scientifiques ont découvert qu '"une variante d'E. Coli productrice de BLSE multirésistante, présente dans le monde, peut être largement transmise entre humains, animaux domestiques et animaux sauvages", selon le RKI. C'est ce que révèlent les analyses de l'arbre généalogique des agents pathogènes. Les échanges entre les différentes espèces ont donc une influence significative sur la propagation des agents pathogènes multirésistants..

Les chercheurs ont découvert que des agents pathogènes multirestiaux circulent entre les humains, les animaux sauvages et domestiques. (Image: JackF / fotolia.com)

Des analyses de pedigree indispensables au contrôle des infections
Outre les chercheurs dirigés par Alan McNally de l'Université de Nottingham Trent, Sebastian Günther et Katharina Schaufler de l'Université libre de Berlin et le président du RKI, Lothar H. Wieler, ont participé à l'étude. En utilisant une nouvelle méthode bioinformatique, les chercheurs ont pu représenter le pedigree de l’agent pathogène avec une résolution élevée sans précédent. De telles "analyses généalogiques (analyses phylogénétiques) sont indispensables pour surveiller le développement, la propagation et la transmission d'agents pathogènes et la résistance aux antibiotiques et pour améliorer la protection contre les infections", rapporte le RKI..

Les agents pathogènes circulent entre les humains, les animaux et les animaux domestiques
Dans le cadre de la présente étude, l'équipe de recherche internationale a analysé l'échange de bactéries E. coli dites productrices de BLSE entre humains, animaux domestiques et animaux d'élevage. Les scientifiques disent depuis un certain temps que "les agents pathogènes - et les traits héréditaires qui rendent la résistance possible - circulent entre l'homme, les animaux et l'environnement", dit le RKI. Un exemple en est la bactérie E. coli productrice de BLSE multirésistante, qui forme des enzymes bactériennes spéciales (appelées bêta-lactamases à spectre étendu, BLSE) et inactive ainsi divers antibiotiques..

Analyses du génome nucléaire ainsi que du génome accessoire et régulateur
Les chercheurs ont analysé plus de 200 isolats d'un variant d'E. Coli producteur de BLSE (type de séquence 131; ST131), provenant de pays et d'hôtes différents. Pour leur étude, ils ont combiné pour la première fois l'analyse détaillée du génome nucléaire à l'analyse du génome accessoire et du génome régulateur, rapporte le RKI. Le génome décrit l'intégralité de toutes les informations pouvant être héritées d'un organisme et le génome nucléaire est présent chez tous les représentants d'une espèce. En outre, il existe cependant des gènes supplémentaires pouvant varier, appelés dans leur ensemble génome accessoire. En outre, les bactéries peuvent "contrôler leur génome de manière ciblée" et "les zones responsables de ce phénomène sont appelées le génome régulateur", explique le RKI..

Regardez l'évolution des agents pathogènes
La combinaison de l'analyse des trois régions du génome a permis aux scientifiques, selon leur propre déclaration, de disposer d'une résolution sans précédent de l'évolution et de la distribution de ces agents pathogènes. En principe, "la surveillance moléculaire, la recherche complète des génomes de pathogènes, ainsi que l'analyse du développement et de la dissémination, dans la lutte contre les infections deviennent de plus en plus importantes", a déclaré le RKI. Les bactéries à Gram négatif multirésistantes (MRGN) menaceraient de plus en plus les progrès de la médecine en médecine humaine et vétérinaire. Un préalable indispensable à la surveillance moléculaire est constitué de séquenceurs puissants et de l'expertise des bioinformaticiens. (Fp)