Mieux reconnaître les maladies infectieuses et sauver des vies
Chaque année, les maladies infectieuses sont la cause de millions de décès dans le monde, une grande partie de ces infections étant causées par de prétendues infections à biofilm, qui restent jusqu'à présent difficiles à diagnostiquer, rapporte le German Heart Center Berlin. Avec une nouvelle méthode, les options de diagnostic - et donc les options de traitement - pourraient être considérablement améliorées à l'avenir.
Les maladies infectieuses comptent parmi les 10 principales causes de décès en Europe et nombre de ces maladies sont causées par des infections dites à biofilms. Le diagnostic est jusqu'à présent extrêmement difficile dans de tels cas. Dans le projet collaboratif iSOLID, financé par le ministère fédéral allemand de l'Education et de la Recherche (BMBF), "la détection rapide et fiable de telles infections à l'aide de diagnostics d'images numériques" doit maintenant faire l'objet de recherches. Le projet collaboratif a également pour objectif de recommander des thérapies adaptées..
Les bactéries peuvent s'accumuler dans ce que l'on appelle des biofilms à différents endroits du corps et entraîner par la suite de graves maladies infectieuses. Le diagnostic de ces infections par biofilm est jusqu'à présent extrêmement difficile. (Image: royaltystockphoto / fotolia.com)Les infections par biofilm sont particulièrement difficiles à reconnaître
Dans le cadre du projet commun iSOLID (Solutions intégrées pour la détection des infections), le centre de biofilm de l'Institut allemand de cardiologie de Berlin, l'Institut Fraunhofer pour les circuits intégrés IIS, HB Technologies AG et CHILI GmbH travaillent ensemble sur de nouvelles solutions pour le diagnostic des infections par biofilm. À l’aide du diagnostic numérique des images, les infections doivent être diagnostiquées plus rapidement et de manière plus sûre. Les infections par biofilm sont responsables d'une proportion significative des maladies infectieuses graves, mais jusqu'à présent, il n'existe pas de méthodes de diagnostic appropriées pour leur détection et leur traitement ciblé, rapporte le German Heart Center Berlin..
Méthode FISH pour la détection des bactéries
Les chercheurs ont recours à la méthode dite "d'hybridation in situ en fluorescence" (FISH), basée sur des sondes d'ADN marquées par fluorescence et qui, selon les experts, combine les avantages de la biologie moléculaire, de la microscopie à fluorescence et de l'histologie. Ainsi, le diagnostic spécifique des maladies infectieuses, qui remontent aux biofilms, est rendu possible. "Grâce à l'étude FISH, les biofilms sont systématiquement visibles et détectables au microscope pour la première fois. Annette Moter du German Heart Center Berlin. Grâce à cette méthode, les bactéries impliquées dans l’infection peuvent être détectées et identifiées, de sorte qu’un traitement spécifique puisse être lancé à temps, poursuit l’expert. Une détection rapide et spécifique des agents pathogènes est essentielle pour le bon choix de l’antibiothérapie..
Développement de nouvelles méthodes de prévention et de traitement
Bien que la méthode FISH soit déjà connue, elle repose sur de très grandes quantités de données d’image, dont l’analyse est compliquée et complexe. Par conséquent, dans le projet commun actuel, une méthode numérique d'analyse d'image pour la détection et la quantification automatiques des microorganismes doit être développée. Le projet a également pour objectif la "solution d'intégration de flux de travail et de traitement des échantillons pour l'analyse quantitative de biofilms en vue de la mise au point de nouvelles méthodes de prévention et de traitement". Avec l'aide d'un système intuitif de communication et d'archivage d'images (PACS), tous les fichiers d'images pertinents doivent être stockés et traités rapidement et en toute sécurité, rapporte le German Heart Center Berlin..
Tout d'abord, il est maintenant prévu de tester les méthodes souhaitées dans le cadre du projet collaboratif iSOLID sur des échantillons de tissus cliniques et également d'évaluer le flux de travail correspondant dans le cadre d'une étude de diagnostic. Par la suite, des possibilités structurelles doivent être créées afin "d'utiliser systématiquement la procédure FISH aux niveaux national et international et de combler ainsi une lacune dans le diagnostic des maladies infectieuses", ont rapporté les scientifiques. (Fp)